La gota o tizón tardío causado por Phytophthora infestans es una de las enfermedades más limitantes en diversos cultivos de solanáceas en el mundo. Este patógeno es especialmente problemático en las zonas andinas altas, donde dichos cultivos se desarrollan bajo condiciones de alta humedad y siembra continua durante todo el año. El objetivo de este trabajo fue aumentar la información disponible sobre la biología de P. infestans, especialmente con respecto a su variabilidad genética en el suroeste de Colombia, región donde confluyen cultivos de diferentes solanáceas susceptibles a este patógeno. La evaluación se realizó mediante la utilización de marcadores moleculares AFLP con las enzimas de restricción EcoRI y MseI y diferentes combinaciones de cebadores. Los resultados obtenidos indicaron un bajo nivel de variación genética entre los 26 aislamientos evaluados, presentándose sólo 18 bandas polimórficas de los 135 amplicones obtenidos (13,43%), un índice de diversidad de Nei de 0,04 y un índice de Shannon de 0,06. A pesar del alto grado de similitud encontrado en la población, el dendrograma generado por el método UPGMA permitió dividir la población en dos grandes grupos. El primero de ellos presentaba aislamientos procedentes de papa (Solanum tuberosum y Solanum phureja), mientras que el segundo incluyó solo aislamientos obtenidos de tomate de árbol (Solanum betaceum). Uno de los aislamientos evaluados (C8) no se agrupó con ninguno de los anteriores grupos, aunque compartió un alto nivel de similitud con éstos (0,86). Los resultados apoyan la hipótesis de la estructuración poblacional de P. infestans en función del hospedante; sin embargo, esta situación requiere ser verificada con evaluaciones de patogenicidad cruzada.

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